秋季腹泻是病毒性感染，有一个自限病程，现今治疗秋季腹泻总的原则是：顺应疾病的自限过程，适当使用药物治疗，积极预防和治疗水电解质紊乱。

1. 注意日常卫生：食品应新鲜、清洁，凡变质的食物均不可喂养宝宝，食具也必须注意消毒；保持饮用水洁净；宝宝及其看护人都应养成饭前便后洗手的好习惯；每次大便后都要用温水擦洗干净，婴儿要及时更换尿布。

2. 提倡母乳喂养：尤其出生后初数月内应以母乳喂养。因母乳适合婴儿的营养需要和消化能力。人乳中含有IgA，可中和大肠杆菌肠毒素，有预防感染埃希氏大肠杆菌的作用。应注意正确的喂养方法，做到定时哺乳，避免在夏季及宝宝有病时断奶。

3. 注意饮食质量：母乳不足或缺母乳采取混合喂养及人工喂养时，应注意饮食调配，不宜过多或过早给米糊或粥食等食品，以免发生碳水化合物消化不良，影响宝宝生长发育。初出生至3个月内婴儿母乳不足，无论用牛乳或代乳品均需要适当稀释，以利于消化和吸收；宝宝食欲不振时，不宜强制进食。

4. 常备药性温和的肠胃药：秋季正值季节转换，儿童由于自身抵抗力较弱，很容易引发各种各样的肠道疾病。因此，细心的妈妈要学会防患于未然，家中常备一些吸收好、药性温和的肠胃药。

5. 不滥用抗生素：秋季腹泻是由病毒引起，抗生素不但无效还会杀死肠道中的正常菌群，引起菌群紊乱，加重腹泻。