结核性肛瘘在我国较为多见，其起病较缓慢，局部疼痛不剧烈，较长时间才有破溃瘘外口；流出的脓稀薄，色白；内口较大，边缘不整齐；外口较多，边缘常凹陷；瘘管分支较多，情况较一般肛瘘复杂。

结核性肛瘘患者，常伴有全身症状，如低热、消瘦、贫血、纳差、乏力、盗汗、咳血等。在治疗中较化脓性肛瘘困难。

治疗上应选用全身抗结核药治疗，如雷米封、链霉素等。手术原则同其他肛瘘，但伤口愈合缓慢，易复发。

东大肛肠医院专家告知：瘘管切开和切除术、挂线疗法、切开挂线法是很多医院延用的治疗肛瘘的办法，但它们却不是治疗肛瘘的好办法。传统的治疗方法在给患者带来痛苦的同时，还伴有大便失禁，括约肌损伤等并发症，究其实质，不外乎肛瘘的切开或切除术以及挂线疗法，这些治疗方法都很容易复发。HCPT微创术则以疼痛小、出血少、快速、等各项优异成绩，使传统疗法黯然失色。

HCPT微创术该手术用新一代进口全电脑多功能肛肠治疗系统HCPT操作，该设备具有高频电容场痔疮治疗功能、高频电刀、电容场止血钳功能。治疗过程疼痛小、出血少、快速、，，不影响工作。治疗后复发率极低。这种微创治疗是利用直肠纤维镜进入到肛门里面，通过监视器，直接对内口进行微创电凝，使肛瘘的内口干结闭合，然后洗干净瘘管里面的脓液，这样大便后，粪便里面的细菌和粪水无法进入周围的组织，由此阻断感染源头及痛感，使之痊愈。