由于不少小儿脱肛有自愈倾向，所以在治疗方面应采取保守疗法。当直肠脱出后，家长应及时使其复位，以免脱垂部位充血、水肿给复位带来困难。让患儿趴在家长的膝上，家长的手指涂上石蜡或麻油，然后缓慢地将脱出的套肠纳入肛门内，然后清洁肛周皮肤，用吊带将纱布垫固定于肛门两侧。若脱出时间长，脱出部位充血水肿，复位有困难，家长应立即带孩子到医院诊治。对多次用保守治疗仍有复发的脱肛小儿，直肠旁酒精注射疗法有效。手术治疗仅限于肛门已松弛，保守及注射疗法均无效的个别患儿。

中医治疗方法多

脐疗法：取枳壳10克，升麻5克，五倍子5克，乌梅5克，共研成细粉状，用醋调成糊状，敷于脐部，外盖纱布用胶布固定，每1～2日1次。

肛周涂药：取乌梅10克，冰片0.2克。将乌梅用小火焙干成碳状，研成细粉，与冰片混合，用香油调成糊状，取少量涂于肛周，每次大便后涂药1次。

中药：中医认为脱肛是因为中气不足、气虚下陷造成，一般用补中益气法，如用炙黄芪12克，升麻6克，柴胡6克，党参10克，陈皮3克，炙甘草3克，煎汤服用。

熏洗法：取补骨脂15克，乌梅10克，五倍子5克，加水1500毫升，煮沸后趁热熏洗肛门，待温后坐浴，每次20分钟，每日2次。